Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL28Q9NXS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL28Q9NXS3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms