Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ING3Q9NXR8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ING3Q9NXR8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ING3Q9NXR8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms