Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVT9

ARMC1, Armadillo repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC1Q9NVT9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARMC1Q9NVT9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARMC1Q9NVT9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms