Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRGBPQ9NV56 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRGBPQ9NV56 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRGBPQ9NV56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms