Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPANXA1Q9NS26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXA1Q9NS26 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXA1Q9NS26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXA1Q9NS26 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXA1Q9NS26 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPANXA1Q9NS26 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms