Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARFGAP3Q9NP61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGAP3Q9NP61 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms