Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4AQ9H3S1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4AQ9H3S1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms