Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL1Q9BYD6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL1Q9BYD6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms