Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZSWIM1Q9BR11 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZSWIM1Q9BR11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZSWIM1Q9BR11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms