Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EBF4Q9BQW3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EBF4Q9BQW3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms