Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSC22D3Q99576 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSC22D3Q99576 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms