Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC38A2Q96QD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC38A2Q96QD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC38A2Q96QD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms