Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ALS2CR12Q96Q35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALS2CR12Q96Q35 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms