Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMG1Q96Q15 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG1Q96Q15 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG1Q96Q15 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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