Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MCEEQ96PE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms