Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PRAC1Q96KF2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PRAC1Q96KF2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms