Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VSIG2Q96IQ7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VSIG2Q96IQ7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms