Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGSM3Q96HU1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SGSM3Q96HU1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SGSM3Q96HU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms