Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPDL1Q96EA4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPDL1Q96EA4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms