Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 71.7
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 218.84■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 71.3
TBRG4Q969Z0 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 71.3
TBRG4Q969Z0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 71.2
TBRG4Q969Z0 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.165e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 KMT2C-206ENST00000424877 5874 ntTSL 56.34□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.485e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 KMT2C-208ENST00000473186 12854 ntTSL 1 (best)4.67□□□□□ -1.665e-7■■■■■ 70.7
TBRG4Q969Z0 ENPP1-203ENST00000486853 732 ntTSL 228.99■■■□□ 2.233e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.153e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.073e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.013e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 23e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 23e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-205ENST00000586531 898 ntTSL 326.96■■□□□ 1.913e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.863e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.853e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 226.37■■□□□ 1.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RBM26-206ENST00000472143 2192 ntTSL 225.89■■□□□ 1.743e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-215ENST00000438863 1005 ntTSL 525.75■■□□□ 1.713e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.693e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.63e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ADSSL1-207ENST00000555486 1012 ntTSL 524.99■■□□□ 1.591e-15■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.563e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.533e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RFX1-205ENST00000589239 2122 ntTSL 224.56■■□□□ 1.523e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.473e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 UCK1-205ENST00000459858 795 ntTSL 523.92■■□□□ 1.423e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP4R4-204ENST00000555690 680 ntTSL 323.62■■□□□ 1.373e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.313e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.271e-15■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RAB27A-210ENST00000567639 592 ntTSL 422.98■■□□□ 1.273e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-224ENST00000592907 543 ntTSL 222.87■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CUTC-201ENST00000370472 727 ntTSL 522.83■■□□□ 1.253e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-15■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AC087477.2-201ENST00000558382 570 ntTSL 322.69■■□□□ 1.223e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.213e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RAB27A-206ENST00000565776 567 ntTSL 422.05■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-209ENST00000587783 679 ntTSL 321.86■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.073e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.063e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.063e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 GGACT-205ENST00000471912 393 ntTSL 321.52■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PHF14-202ENST00000423760 2627 ntTSL 221.5■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP1R37-204ENST00000540059 1719 ntTSL 221.45■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IMPA2-210ENST00000590107 1616 ntTSL 521.35■■□□□ 1.013e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CEP131-207ENST00000573053 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.26■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-220ENST00000591942 564 ntTSL 521.26■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ERLIN1-201ENST00000370408 962 ntTSL 521.06■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 C19orf54-205ENST00000596809 1104 ntTSL 520.96■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM241-202ENST00000460322 889 ntTSL 520.78■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 220.77■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 USP36-212ENST00000588365 546 ntTSL 420.7■□□□□ 0.93e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LYSMD4-209ENST00000496108 2222 ntTSL 220.63■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ATP7B-216ENST00000635406 506 ntTSL 420.5■□□□□ 0.872e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-10■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 RNF44-203ENST00000504434 785 ntTSL 220.34■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 320.32■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ENPP1-204ENST00000513998 3107 ntTSL 520.27■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IMPA2-205ENST00000588752 651 ntTSL 320.09■□□□□ 0.813e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DDB1-220ENST00000542337 558 ntTSL 319.73■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 DHX38-202ENST00000562774 500 ntTSL 419.71■□□□□ 0.753e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 IMPA2-211ENST00000590138 895 ntTSL 519.52■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 TMEM39B-207ENST00000476968 1994 ntTSL 519.28■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CEP350-210ENST00000491495 1059 ntTSL 519.24■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 70.6
TBRG4Q969Z0 SPNS3-206ENST00000576069 834 ntTSL 519.08■□□□□ 0.643e-8■■■■■ 70.6
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 290.6 ms