Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPTSSAQ969W0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTSSAQ969W0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTSSAQ969W0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms