Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC3Q92529 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC3Q92529 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC3Q92529 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC3Q92529 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SHC3Q92529 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHC3Q92529 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHC3Q92529 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHC3Q92529 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms