Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFT2D1Q8WV19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFT2D1Q8WV19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D1Q8WV19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms