Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD22

SFXN5, Sideroflexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN5Q8TD22 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFXN5Q8TD22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SFXN5Q8TD22 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SFXN5Q8TD22 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.7 ms