Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMO3Q8TAP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO3Q8TAP4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO3Q8TAP4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms