Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATA4Q8NEY3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATA4Q8NEY3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATA4Q8NEY3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms