Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER1Q8NEC5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER1Q8NEC5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CATSPER1Q8NEC5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms