Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PNLDC1Q8NA58 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PNLDC1Q8NA58 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms