Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTUD6BQ8N6M0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms