Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LGI3Q8N145 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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LGI3Q8N145 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LGI3Q8N145 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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