Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KIRREL3Q8IZU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIRREL3Q8IZU9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIRREL3Q8IZU9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms