Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC170Q8IYT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC170Q8IYT3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms