Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNGA4Q8IV77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNGA4Q8IV77 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGA4Q8IV77 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms