Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI8

CRLF3, Cytokine receptor-like factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLF3Q8IUI8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRLF3Q8IUI8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRLF3Q8IUI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms