Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDSS2Q86YH6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDSS2Q86YH6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDSS2Q86YH6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms