Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFNEQ86WN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFNEQ86WN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFNEQ86WN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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