Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMC3Q7Z5M5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMC3Q7Z5M5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms