Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC80Q76M96 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC80Q76M96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC80Q76M96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms