Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATF7IPQ6VMQ6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATF7IPQ6VMQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATF7IPQ6VMQ6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms