Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CSAG1Q6PB30 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CSAG1Q6PB30 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms