Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRNP1Q6NT89 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRNP1Q6NT89 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRNP1Q6NT89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms