Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SUMO4Q6EEV6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SUMO4Q6EEV6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SUMO4Q6EEV6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms