Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
REP15Q6BDI9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
REP15Q6BDI9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms