Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
AGAP6Q5VW22 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AGAP6Q5VW22 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms