Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms