Protein–RNA interactions for Protein: Q5T655

CFAP58, Cilia- and flagella-associated protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP58Q5T655 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP58Q5T655 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP58Q5T655 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP58Q5T655 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms