Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC122Q5T0U0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC122Q5T0U0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms