Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMPK2Q5EBM0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMPK2Q5EBM0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMPK2Q5EBM0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms