Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC38Q502W7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC38Q502W7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms