Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCNMB1Q16558 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCNMB1Q16558 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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